Po ukončení projektu na vybudování strategického letectva v roce 1937 byl prototyp Ju 89 V3 přestavěn na transportní Ju 90 V1(D-AALU)Der große Dessauer. Lišil se zcela překonstruovaným trupem, křídla a ocasní plochy byla prakticky identická.

Velký zájem měla o letoun Lufthansa, která také objednala tři prototypy a desetikusovou sérii. Prototypy Ju 90 V2(D-AIVI)Preußen a Ju 90 V3(D-AURE)Bayernbyly zalétány v průběhu roku 1938 s motory BMW 132H (880 k) a nasazeny na civilní linky pro dopravu 38-40 cestujících.

Stroje ve verzi B-1 nesly označení jako prototypy, i když mělo jít podle objednávky o sériové stroje. Prototypem pro tuto sérii byl Ju 90 V4(D-ADLH)Sachsen, následovaly stroje V5(D-ABDG)Württenberg,V6(D-AEDS)Preußen, nesoucí toto jméno místo zničeného V2 V7(D-ADFJ)Baden.

Jihoafrické aerolinie si objednaly dva stroje s motory Pratt&Whitney, které byly označeny V8 a V9, po začátku války ale z dodávky sešlo a letoun V8, původně označený D-AQJA,byl přeznačen vojenskou imatrikulací (DJ+YE) a obrannou výzbroj ve hřbetní a věži a ocasním střelišti.

Lufthansa ještě dostala letouny V10(D-ASND)Mecklenburg,V11(D-AFHG)Oldenburg, V12(D-ATDC)Hessen,V13(D-AJHB)Thüringen a V14(D-AVMF)Brandenburg. Po vypuknutí války a velkém omezení civilní dopravy byly postupně používány pro vojenskou dopravu a evakuaci raněných.

Stručná charakteristika
Rozpětí (m)	35,02
Délka (m)	26,30
Výška (m)	6,85
Nosná plocha (m2)
Vzlet.hmotnost (kg)	23000
Max. rychlost (km/h)	350
ve výšce (m)	3000
Dostup (m)	5500
Dolet (km)	2100
Vyrobeno (ks)	14

«»